Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFKPQ01813 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms