Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSG9Q00887 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms