Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA2P62736 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms