Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPD1P62314 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPD1P62314 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms