Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4CP60510 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms