Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms