Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP11P51784 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP11P51784 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP11P51784 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP11P51784 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP11P51784 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP11P51784 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP11P51784 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP11P51784 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP11P51784 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP11P51784 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP11P51784 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP11P51784 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP11P51784 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP11P51784 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP11P51784 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP11P51784 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP11P51784 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms