Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC3P51654 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC3P51654 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC3P51654 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC3P51654 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC3P51654 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC3P51654 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC3P51654 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC3P51654 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC3P51654 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC3P51654 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms