Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME1P48163 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME1P48163 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME1P48163 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME1P48163 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME1P48163 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME1P48163 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME1P48163 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME1P48163 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME1P48163 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms