Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL35P42766 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL35P42766 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms