Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SERTAD3-203ENST00000596456 535 ntTSL 317.96■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FURIN-203ENST00000559353 587 ntTSL 317.72■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX56-205ENST00000433257 1682 ntTSL 517.7■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FAM111A-203ENST00000527629 867 ntTSL 317.42■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SMUG1-225ENST00000635546 1115 ntTSL 517.34■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SCLY-215ENST00000480357 5668 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 VPS8-213ENST00000453056 661 ntTSL 316.89■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HDAC7-211ENST00000433685 402 ntTSL 316.82■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-202ENST00000393711 608 ntTSL 516.72■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 C8orf82-203ENST00000527462 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FAM111A-205ENST00000529358 545 ntTSL 416.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX56-208ENST00000467318 1665 ntTSL 516.02■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TMEM248-204ENST00000424964 536 ntTSL 416.01■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX56-206ENST00000446987 1853 ntTSL 515.97■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-215ENST00000540792 951 ntTSL 215.9■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HOXC9-202ENST00000504557 581 ntTSL 315.81■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-217ENST00000483350 988 ntTSL 315.69■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 UBE2F-SCLY-202ENST00000449891 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.51■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SERTAD3-204ENST00000599706 747 ntTSL 215.46■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF846-211ENST00000592587 548 ntTSL 515.39■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 NCOR2-209ENST00000440187 467 ntTSL 515.3■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 315.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FAM111A-208ENST00000531408 423 ntTSL 315.2■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HOXC6-203ENST00000504315 538 ntTSL 315.19■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HDAC7-215ENST00000447463 555 ntTSL 415□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TMEM248-203ENST00000418375 545 ntTSL 414.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF846-203ENST00000586814 482 ntTSL 514.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-207ENST00000526549 2375 ntTSL 214.29□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-218ENST00000475913 534 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.124e-13■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-212ENST00000539985 1252 ntTSL 214.13□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-260ENST00000625824 692 ntTSL 514.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-216ENST00000541725 560 ntTSL 514.05□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SMUG1-224ENST00000635234 484 ntTSL 513.96□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-205ENST00000594076 2193 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DNMT3B-201ENST00000201963 4255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RARA-210ENST00000582914 581 ntTSL 413.52□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-206ENST00000525243 812 ntTSL 213.41□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-204ENST00000392965 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.274e-13■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-203ENST00000392962 1497 ntTSL 213.31□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-207ENST00000595208 1511 ntTSL 213.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RARA-208ENST00000577646 733 ntTSL 513.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 213.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-209ENST00000432194 503 ntTSL 512.98□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-247ENST00000608737 956 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF581-201ENST00000270451 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF581-204ENST00000588537 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX56-212ENST00000485367 1781 ntTSL 512.43□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-207ENST00000535758 505 ntTSL 312.32□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-212ENST00000601345 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-229ENST00000596584 863 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-202ENST00000360222 3330 ntTSL 211.76□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 AC008443.5-202ENST00000508877 392 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.614e-13■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-281ENST00000626969 745 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TMEM248-202ENST00000413593 637 ntTSL 411.03□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TEC-201ENST00000381501 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RAB8B-202ENST00000558119 774 ntTSL 210.83□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF846-207ENST00000589412 683 ntTSL 510.76□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-225ENST00000484529 400 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.754e-13■■■■■ 30.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 142.2 ms