Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GCAP28676 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GCAP28676 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCAP28676 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCAP28676 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCAP28676 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCAP28676 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms