Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5F1P24539 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5F1P24539 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5F1P24539 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5F1P24539 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms