Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms