Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms