Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms