Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIP12755 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIP12755 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIP12755 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIP12755 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIP12755 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIP12755 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIP12755 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIP12755 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIP12755 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIP12755 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIP12755 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIP12755 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIP12755 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIP12755 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIP12755 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIP12755 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIP12755 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIP12755 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKIP12755 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKIP12755 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKIP12755 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKIP12755 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIP12755 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIP12755 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms