Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD28P10747 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD28P10747 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD28P10747 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD28P10747 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD28P10747 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD28P10747 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD28P10747 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD28P10747 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD28P10747 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD28P10747 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD28P10747 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms