Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF40O75150 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF40O75150 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF40O75150 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF40O75150 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF40O75150 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF40O75150 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF40O75150 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF40O75150 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF40O75150 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF40O75150 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF40O75150 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF40O75150 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF40O75150 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms