Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms