Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OIP5O43482 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OIP5O43482 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OIP5O43482 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OIP5O43482 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OIP5O43482 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OIP5O43482 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OIP5O43482 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OIP5O43482 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OIP5O43482 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OIP5O43482 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OIP5O43482 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms