Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms