Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3QW42 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3QW42 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3QW42 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QW42 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QW42 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QW42 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QW42 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QW42 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QW42 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QW42 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QW42 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QW42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms