Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms