Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 STRN4-219ENST00000600615 788 ntTSL 213.34□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PRPF8-208ENST00000573716 542 ntTSL 212.89□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-207ENST00000480370 487 ntTSL 211.95□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 EMC3-AS1-201ENST00000326237 2882 ntTSL 211.3□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-208ENST00000482975 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-204ENST00000438261 515 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PAXBP1-209ENST00000497873 2277 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-207ENST00000467009 1831 ntTSL 29.6□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-209ENST00000471341 5097 ntTSL 29.23□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-212ENST00000497935 666 ntTSL 28.77□□□□□ -1.011e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.121e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-209ENST00000488400 393 ntTSL 28.05□□□□□ -1.121e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.151e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-207ENST00000525050 513 ntTSL 37.25□□□□□ -1.251e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-213ENST00000527069 573 ntTSL 56.24□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GPCPD1-205ENST00000481038 6649 ntTSL 25.41□□□□□ -1.541e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 EMC3-AS1-206ENST00000440568 558 ntTSL 45.08□□□□□ -1.61e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.621e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.621e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GPCPD1-202ENST00000418646 4015 ntTSL 54.51□□□□□ -1.691e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 EMC3-AS1-203ENST00000424904 433 ntTSL 34.35□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 11e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-203ENST00000439080 1388 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-225ENST00000621715 816 ntTSL 317.7■□□□□ 0.421e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-231ENST00000639599 1283 ntTSL 515.53■□□□□ 0.081e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-204ENST00000472476 1001 ntTSL 515.08■□□□□ 01e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-217ENST00000616545 920 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-226ENST00000621790 1008 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-229ENST00000638264 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-230ENST00000639083 2269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 511.71□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-218ENST00000619183 1595 ntTSL 512.21□□□□□ -0.465e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-203ENST00000588116 779 ntTSL 56.79□□□□□ -1.325e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-219ENST00000574340 579 ntTSL 319.44■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-209ENST00000535641 2627 ntTSL 213.09□□□□□ -0.311e-11■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 MIR647-201ENST00000384823 96 ntBASIC11.67□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 CHD2-229ENST00000637789 904 ntTSL 510.28□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-213ENST00000538334 6149 ntTSL 510.1□□□□□ -0.791e-11■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-214ENST00000539079 1715 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.821e-11■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 LARP1B-207ENST00000507377 1593 ntTSL 29.92□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-212ENST00000538223 292 ntTSL 59.81□□□□□ -0.841e-11■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-207ENST00000535472 1048 ntTSL 59.73□□□□□ -0.851e-11■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-219ENST00000544314 1508 ntTSL 29.57□□□□□ -0.881e-11■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-221ENST00000545218 1328 ntTSL 58.78□□□□□ -11e-11■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.135e-9■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 FANCI-212ENST00000566895 4663 ntTSL 26.84□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 FANCI-204ENST00000561894 3268 ntTSL 23.38□□□□□ -1.872e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-205ENST00000482968 1754 ntTSL 216.26■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 22.3
UTP3Q9NQZ2 PRRC2C-212ENST00000498596 1066 ntTSL 311.02□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 22.3
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 527.45■■□□□ 1.988e-8■■■■□ 22.3
UTP3Q9NQZ2 GLUL-208ENST00000475808 868 ntTSL 29.45□□□□□ -0.94e-7■■■■□ 22.2
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 413.29□□□□□ -0.283e-7■■■■□ 22.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 211.22□□□□□ -0.613e-7■■■■□ 22.1
UTP3Q9NQZ2 SLC6A8-210ENST00000485324 2401 ntTSL 222.09■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 22.1
UTP3Q9NQZ2 PTBP1-217ENST00000592113 1548 ntTSL 524.21■■□□□ 1.471e-6■■■■□ 22.1
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.631e-6■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 GUK1-228ENST00000485168 737 ntTSL 317.32■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 GUK1-223ENST00000478725 414 ntTSL 314.53□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 RALB-207ENST00000470417 1931 ntTSL 327.18■■□□□ 1.942e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 325.48■■□□□ 1.672e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.432e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 RALB-204ENST00000431732 767 ntTSL 523.82■■□□□ 1.42e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.42e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.392e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-206ENST00000487350 785 ntTSL 1 (best)23.16■■□□□ 1.32e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PPP1CB-205ENST00000420282 570 ntTSL 422.14■■□□□ 1.132e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PPP1CB-206ENST00000427786 569 ntTSL 420.79■□□□□ 0.922e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 ZSWIM8-204ENST00000431225 1687 ntTSL 519.17■□□□□ 0.662e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.632e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 RALB-206ENST00000449649 667 ntTSL 517.99■□□□□ 0.472e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 RALB-202ENST00000412383 981 ntTSL 317.66■□□□□ 0.422e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 BCR-208ENST00000466076 495 ntTSL 317.04■□□□□ 0.322e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-205ENST00000482246 414 ntTSL 316.65■□□□□ 0.262e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PPP1CB-207ENST00000441461 584 ntTSL 215.91■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-204ENST00000553368 304 ntTSL 315.86■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 215.32■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -02e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-205ENST00000553555 1603 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 22
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