Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-214ENST00000567266 546 ntTSL 421.38■■□□□ 1.013e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-213ENST00000567241 561 ntTSL 419.84■□□□□ 0.773e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.713e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 PARK7-205ENST00000460192 567 ntTSL 318.18■□□□□ 0.53e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-215ENST00000568339 2271 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-210ENST00000566115 471 ntTSL 316.32■□□□□ 0.23e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.033e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.013e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 PARK7-206ENST00000465354 949 ntTSL 214.92□□□□□ -0.023e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-206ENST00000564544 617 ntTSL 314.37□□□□□ -0.113e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-218ENST00000570123 551 ntTSL 514.14□□□□□ -0.153e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 PARK7-208ENST00000493373 624 ntTSL 513.75□□□□□ -0.213e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-204ENST00000562929 452 ntTSL 513.6□□□□□ -0.233e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-211ENST00000566405 490 ntTSL 512.81□□□□□ -0.363e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 CTNND1-224ENST00000530068 579 ntTSL 411.79□□□□□ -0.523e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-217ENST00000569997 3946 nt10.33□□□□□ -0.763e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 COX4I1-207ENST00000564648 1235 ntTSL 59.45□□□□□ -0.93e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 VARS-219ENST00000461328 662 ntTSL 316.43■□□□□ 0.227e-7■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.136e-8■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 SLC6A8-206ENST00000457723 266 ntTSL 513.05□□□□□ -0.325e-7■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 SLC6A8-205ENST00000442457 523 ntTSL 313.02□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 22.9
UTP3Q9NQZ2 P4HB-204ENST00000466567 872 ntTSL 222.25■■□□□ 1.153e-6■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 YME1L1-204ENST00000396296 986 ntTSL 521.51■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 YME1L1-207ENST00000477432 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 YME1L1-205ENST00000427324 775 ntTSL 39.56□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-7■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-7■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.119e-11■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 MCM4-206ENST00000519138 927 ntTSL 213.46□□□□□ -0.259e-11■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 KXD1-212ENST00000600099 517 ntTSL 213.25□□□□□ -0.299e-11■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 KXD1-205ENST00000595870 686 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.559e-11■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 KXD1-208ENST00000597438 635 ntTSL 311.46□□□□□ -0.579e-11■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 KXD1-209ENST00000598830 932 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.619e-11■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-209ENST00000586778 1001 ntTSL 28.25□□□□□ -1.099e-11■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-210ENST00000589919 595 ntTSL 27.33□□□□□ -1.249e-11■■■■□ 22.8
UTP3Q9NQZ2 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.414e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 FANCI-210ENST00000565522 233 ntTSL 55.39□□□□□ -1.554e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.614e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 FANCI-203ENST00000447611 3690 ntTSL 23.69□□□□□ -1.824e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 BBC3-206ENST00000601438 1747 nt19.18■□□□□ 0.664e-9■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 MPP1-209ENST00000453245 729 ntTSL 513.63□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 22.7
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 515.81■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 ATP5F1-205ENST00000483994 678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.545e-7■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 ATP5F1-203ENST00000464154 621 ntTSL 210.37□□□□□ -0.755e-7■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 ATP5F1-201ENST00000369721 1040 ntTSL 28.36□□□□□ -1.075e-7■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 ATP5F1-204ENST00000468818 859 ntTSL 37.44□□□□□ -1.225e-7■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-227ENST00000640264 328 ntTSL 311.05□□□□□ -0.647e-10■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-211ENST00000489705 451 ntTSL 310.35□□□□□ -0.757e-10■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-208ENST00000475997 5290 ntTSL 57.2□□□□□ -1.267e-10■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-203ENST00000366527 12852 ntTSL 25.09□□□□□ -1.67e-10■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 TBL1XR1-225ENST00000636187 171 ntTSL 519.2■□□□□ 0.664e-12■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 TBL1XR1-230ENST00000637123 138 ntTSL 51.27□□□□□ -2.214e-12■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 LONP1-208ENST00000589473 793 ntTSL 316.63■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 AUP1-205ENST00000464887 845 ntTSL 214.88□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.863e-24■■■■□ 22.6
UTP3Q9NQZ2 BRD2-204ENST00000449025 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 CAPN2-209ENST00000487223 2991 ntTSL 27.36□□□□□ -1.234e-6■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 GTPBP2-210ENST00000496137 516 ntTSL 37.34□□□□□ -1.233e-9■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-201ENST00000503704 637 ntTSL 210.62□□□□□ -0.719e-7■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-209ENST00000509007 566 ntTSL 410.62□□□□□ -0.719e-7■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-205ENST00000504869 535 ntTSL 49.13□□□□□ -0.959e-7■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.483e-6■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 22.5
UTP3Q9NQZ2 MVD-205ENST00000562981 537 ntTSL 217.99■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 CHD9-208ENST00000563410 488 ntTSL 222.16■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.991e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-232ENST00000610893 578 ntTSL 420.98■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 EDEM1-203ENST00000443790 730 ntTSL 220.96■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 STRN4-222ENST00000601869 2240 nt20.39■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 STRN4-208ENST00000594581 2692 ntTSL 219.27■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PSMB4-206ENST00000495288 986 ntTSL 218.98■□□□□ 0.633e-12■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 GUK1-231ENST00000485859 325 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.391e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 516.94■□□□□ 0.33e-12■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 MIER2-203ENST00000587966 462 ntTSL 516.67■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-234ENST00000612845 527 ntTSL 415.98■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TXNDC11-205ENST00000572732 1509 nt15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-228ENST00000600499 580 ntTSL 215.55■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 214.39□□□□□ -0.113e-12■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-12■■■■□ 22.4
UTP3Q9NQZ2 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 214.18□□□□□ -0.143e-12■■■■□ 22.4
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