Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRID1Q9ULK0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRID1Q9ULK0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms