Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms