Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCDC2Q9UHG0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCDC2Q9UHG0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms