Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS2Q9NYR9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms