Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASF1BQ9NVP2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms