Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 RNH1-211ENST00000526295 488 ntTSL 318.17■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-221ENST00000532055 704 ntTSL 313.84□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-220ENST00000531540 480 ntTSL 29.89□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 MARK4-203ENST00000587566 553 ntTSL 522.91■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.222e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 314.8□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 515□□□□□ -0.018e-11■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.753e-11■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.753e-11■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 MCM7-204ENST00000425308 1497 ntTSL 343.1■■■■■ 4.493e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 MYRF-206ENST00000537766 1392 ntTSL 337.6■■■■□ 3.613e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.523e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-213ENST00000421556 2168 ntTSL 234.34■■■■□ 3.093e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.063e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-223ENST00000494397 1752 ntTSL 533.68■■■□□ 2.983e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.933e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.883e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 431.47■■■□□ 2.633e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-215ENST00000431822 935 ntTSL 529.88■■■□□ 2.373e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 229.13■■■□□ 2.253e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-217ENST00000466928 840 ntTSL 229.11■■■□□ 2.253e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.243e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 AC011448.1-202ENST00000586674 1071 ntTSL 228.88■■■□□ 2.213e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 JUP-212ENST00000591690 583 ntTSL 328.8■■■□□ 2.23e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.943e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RAF1-203ENST00000423275 2354 ntTSL 227.15■■□□□ 1.943e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 SCRIB-205ENST00000526832 2189 ntTSL 1 (best)26.95■■□□□ 1.93e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.93e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 JUP-208ENST00000449889 1069 ntTSL 326.93■■□□□ 1.93e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-222ENST00000494302 2667 ntTSL 526.02■■□□□ 1.763e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.753e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.673e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-207ENST00000420383 2817 ntTSL 224.78■■□□□ 1.563e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.69■■□□□ 1.543e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 INHBE-203ENST00000551553 1228 ntTSL 1 (best)24.49■■□□□ 1.513e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.53e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-219ENST00000470209 2889 ntTSL 523.93■■□□□ 1.423e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 JUP-206ENST00000437187 1029 ntTSL 323.57■■□□□ 1.363e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 JUP-205ENST00000424457 949 ntTSL 323.57■■□□□ 1.363e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 INHBE-202ENST00000547970 1056 ntTSL 323.53■■□□□ 1.363e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 AC068205.2-202ENST00000636894 2134 nt23.47■■□□□ 1.353e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RAF1-202ENST00000416093 962 ntTSL 222.91■■□□□ 1.263e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-205ENST00000404127 3232 ntTSL 522.74■■□□□ 1.233e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 YJEFN3-202ENST00000458210 2785 ntTSL 222.4■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.163e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.163e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 CTTN-213ENST00000529736 952 ntTSL 322.21■■□□□ 1.153e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 INHBE-204ENST00000553033 569 ntTSL 422.09■■□□□ 1.133e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.073e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 JUP-211ENST00000589036 566 ntTSL 421.58■■□□□ 1.043e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 L1CAM-212ENST00000464967 593 ntTSL 220.79■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 JUP-209ENST00000465293 432 ntTSL 520.73■□□□□ 0.913e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.893e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DCXR-211ENST00000579821 452 ntTSL 319.92■□□□□ 0.783e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.653e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.633e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DCXR-208ENST00000579004 341 ntTSL 318.85■□□□□ 0.613e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.523e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.433e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DCXR-216ENST00000582074 631 ntTSL 317.31■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DCXR-202ENST00000577286 553 ntTSL 217.28■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 HOXB8-202ENST00000498634 502 ntTSL 316.38■□□□□ 0.213e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 AC068205.2-203ENST00000529261 748 ntTSL 315.9■□□□□ 0.143e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 AC068205.1-202ENST00000533358 475 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 VAPB-206ENST00000520497 937 ntTSL 213.05□□□□□ -0.323e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 VAPB-201ENST00000265619 3596 ntTSL 211.34□□□□□ -0.593e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 MLLT1-202ENST00000585588 637 ntTSL 325.16■■□□□ 1.622e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ZMYM2-204ENST00000382881 1912 ntTSL 236.52■■■■□ 3.445e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.555e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.065e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.775e-7■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.583e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.243e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.924e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DYNC1LI2-212ENST00000568180 573 ntTSL 526.3■■□□□ 1.84e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DYNC1LI2-210ENST00000566150 568 ntTSL 326■■□□□ 1.754e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.564e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.424e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.746e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-219ENST00000530892 691 ntTSL 234.98■■■■□ 3.199e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-208ENST00000598415 715 ntTSL 234.97■■■■□ 3.196e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-212ENST00000602075 763 ntTSL 334.97■■■■□ 3.196e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TCF12-208ENST00000557947 575 ntTSL 433.89■■■■□ 3.026e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-210ENST00000600559 550 ntTSL 232.83■■■□□ 2.856e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-217ENST00000530650 2094 ntTSL 1 (best)32.83■■■□□ 2.859e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-215ENST00000529414 749 ntTSL 332.78■■■□□ 2.849e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 HMGB3-205ENST00000455596 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)32.55■■■□□ 2.86e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.689e-11■■■■□ 21.9
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