Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMMDC1Q9NPL8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms