Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDT1Q9H211 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDT1Q9H211 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms