Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXP3Q9BZS1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXP3Q9BZS1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXP3Q9BZS1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXP3Q9BZS1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms