Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms