Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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FAM46AQ96IP4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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FAM46AQ96IP4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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FAM46AQ96IP4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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FAM46AQ96IP4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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FAM46AQ96IP4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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FAM46AQ96IP4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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