Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms