Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms