Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms