Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms