Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U6

RNF10, RING finger protein 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF10Q8N5U6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF10Q8N5U6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF10Q8N5U6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms