Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms