Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms