Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms