Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
METAP1DQ6UB28 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms