Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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