Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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