Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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