Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SURF2Q15527 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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